晴朗时节，江户川柯南和毛利小五郎、小兰以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代，战舰上突然发现一条断掉的手臂，消失的自卫队员又引起军方的恐慌与猜测。原来某国神秘间谍 X 已悄悄登上宙斯盾，伺机盗取战舰上的绝密情报。为了找出隐藏的对手，柯南和灰原哀、阿笠博士、服部平次以及远山和叶通力合作，与间谍展开连番斗智斗勇的较量。
演员: 新井泉
/ 木下 桃吉郎
/ 小山 力也
/ 柴崎幸
/ 山崎 和佳奈
/ 邪封淋
/ Kenichi Ogata
/ 岩居 由希子
/ 高木 渉
/ 大谷 育江
/ 林原 惠
/ 松井 菜桜子
/ 堀川亮
/ 宫村优子
/ 置鲇龙太郎
/ 天田 益男
/ 成田 剣
/ Atsuko Yuya
/ Kohsei Hirota
