以635米的高度为傲、可以俯瞰东京街景的铃木塔（注：以现实中634米的东京晴空塔为原型）竣工。前往参加其开幕仪式的柯南等人，从眺望台上享受着绝美的景色。就在此时，一发子弹击碎了窗户玻璃，打穿了一个男人的胸膛。案件发生于一瞬之间，完全搞不清到底发生了什么，小兰与少年侦探团都陷入了恐慌。
柯南立刻利用追踪眼镜的望远镜功能，沿着弹道发现了一个黑色的身影。“从那么远的距离进行狙击，怎么可能？！”柯南马上与女高中生侦探世良真纯乘坐摩托车追赶逃走的狙击手，意想不到的是狙击手居然连警察的巡逻车都打算一起炸掉，整个追踪过程都被其玩弄于股掌之中。结果，这场激烈的追踪将FBI也卷入其中，犯人以及狙击事件的谜团都消失在了大海里。
于是柯南和世良协力，而警察和FBI合作调查此案，终于查出了美国海军特种部队“海豹突击队”的存在。其实这起狙击事件不过是接下来将发生的大混乱的第一步！与此同时，住在工藤新一家的神秘研究生冲矢昴也不动声色地秘密行动起来……
演员: 新井泉
/ 山崎 和佳奈
/ 小山 力也
/ 木下 桃吉郎
/ 林原 惠
/ 日高范子
/ 池田 秀一
/ 家弓家正
/ 梁田 清之
/ 置鲇龙太郎
/ 邪封淋
/ 井上 和彦
/ 高木 渉
/ Atsuko Yuya
/ Kenichi Ogata
/ 岩居 由希子
/ 大谷 育江
/ 松井 菜桜子
/ Sota Fukushi
/ Chikao Ohtsuka
/ 辻亲八
/ 中井 和哉
