故事發生在虛構的、在廢棄堆填區上興建的未來城市－洲籠市。這個城市曾經發展急促，但現在人口正逐年減少。
在暑假前數天，一位神祕又無表情的女子－園崎法子告訴他的同學阿形勝平，他被選為一位「羈絆者Kiznaiver」，因為他感覺不到疼痛。他們一起體會到共享疼痛的羈絆。這種羈絆可讓勝平分享他的痛以及聯繫與他生活、性格都不同的的同學。而他的同學，包括法子在內，都是不同的「羈絆者」。
這個羈絆系統的最終目標是透過傷痛連接眾人回憶及經驗，創造世界和平。當一位羈絆者受創傷時，系統會把他／她的痛苦轉移到其他的羈絆者身上。勝平的同學們承擔彼此的痛苦，而法子負責分配大家的任務。
