遭不能對話之異生物・奇居子破壞的太陽系。
險得殘活的人類一部、乃選擇以小行星作為船体巨大宇宙船SIDONIA繁殖並旅居宇宙的路子。
其後約經1000年的時光
SIDONIA出航紀元1009年。
在最下層部寂養的少年・谷風長道於祖父死期上街。
長道於是入學人型巨大裝甲・衛人的操縱士訓練學校、在那邊初次接觸到祖父以外的人類。
長道最初意識的少女——星白閑
成了長道最初的友人
連男女都不是的人類——科戸瀬IZANA
對長道活躍自覺坐立難安的少年岐神海苔夫
與一樣樣訓練生過遣學校生活當中、終究降下最初任務。
那絕不該是困難任務。
可是長道們跟前突如其來、出現奇居子。
與間隔100年的威脅遭遇、
人類、長道、將作何選擇呢？
賭上肩負人類存亡的一戰、如今開始——
演員: 逢坂 良太
/ 大原沙耶香
/ 櫻井 孝宏
/ Aki Toyosaki
/ Hisako Kanemoto
/ 新井 里美
/ 喜多村英梨
/ 田中 敦子
/ 鳥海 浩輔
