在电影开始开篇，场景被设置在40年前的一片大森林中。一个叫雪成的男孩想进去那个森林去画画，在森林内，雪成遇到了被神奇宝贝猎人追捕并受重伤的雪拉比，当他们被神奇宝贝猎人追的走投无路的时候，雪拉比带着雪成到了40年后（现代），正好小智他们在这森林里，他们救了雪成，雪成告诉了小智他们关于时拉比的事，小智他们救了雪拉比，并和他成为了好朋友。与此同时，火箭队的三干部比夏斯也在寻找着并打算捕猎雪拉比。比夏斯拥有能将一切神奇宝贝变得凶恶的黑暗球，将雪拉比自小智他们的身边夺走。为了拯救被比夏斯捕捉的雪拉比，小智与雪成拼命奋战。可是，温柔的雪拉比已经发生了很大的变化…… 激烈的对战中，传说中的神奇宝贝水君出现了！小智他们能否拯救雪拉比和森林呢......
演员: 松本 梨香
/ 大谷 育江
/ Unsho Ishizuka
/ 饭冢雅弓
/ 上田 祐司
/ 関 智一
/ 林原 惠
/ 四季透
/ 犬山犬子
/ Keiko Toda
/ 小山茉美
/ 渋川佳寿子
/ 田中 正彦
/ 仲木 里江
/ 大野朋
/ 中川由美
/ 坂口 候一
/ 富士 爆発
/ 江川 央生
/ Akiko Suzuki
/ Ryoka Yuzuki
/ Tomoyuki Kouno
/ 佐野 史郎
/ Takashi Fujii
/ Anne Suzuki
/ 山寺 宏一
